培養法
水中細菌的濃度與該水源生物污染可能性是有直接關系的，細菌總數（TBC）是水樣中已有微生物總數量的定量表示值，用陶氏膜過濾一定量的水樣來確定細菌總數。將截留在陶氏膜表面的生物組織，置于一定的營養物中進行培養，形成菌落，通過低倍放大鏡就可以觀察到并對菌落進行計數。
這一方法的主要優點是無需昂貴的儀器設備就可以進行，但是測定結果要等到7天之后才能得出，被計數的菌落也僅為實際活微生物總量的1~10%左右。然而，培養技術仍然是表示微生物污染可能性程度和趨勢的有效方法。它可以用于觀察陶氏膜進水、濃水和產水中的情況。如果陶氏膜濃水中總細菌數增加，就表明膜元件內出現了生物膜污染。
直接細菌計數
直接計數技術采取先過濾水樣，然后在顯微鏡下直接對截留在陶氏膜上的微生物進行計數。為了使得微生物能夠觀察到，需要對微生物用沙黃進行著色，然后在透光熒光顯微鏡下進行計數。
這樣陶氏膜需要過濾的原水總微生物的準確數量就可以立刻獲得，微生物的類型可以從沉積顆粒上進行區分。但是細胞組織的死活情況就無法進行區分要采用INT技術。
生物膜檢測
未經處理的原水、陶氏膜裝置進水和濃水中的微生物含量是評估潛在陶氏膜生物污染的重要指標。但其它因素如營養成份的濃度和種類、操作參數也決定了生物膜的發展，目前人們還沒有充分認識清楚生物膜，實際系統操作過程中，定期仔細地檢查預處理系統以及進水和濃水管內表面，也是有效的做法，當出現粘泥和異味時就表明有陶氏膜的微生物污染。
